Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
ATMQ13315 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
ATMQ13315 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC0.64□□□□□ -2.31
ATMQ13315 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ATMQ13315 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
ATMQ13315 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
ATMQ13315 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ATMQ13315 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
ATMQ13315 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ATMQ13315 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
ATMQ13315 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
ATMQ13315 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ATMQ13315 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ATMQ13315 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ATMQ13315 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ATMQ13315 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ATMQ13315 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ATMQ13315 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ATMQ13315 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ATMQ13315 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ATMQ13315 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
ATMQ13315 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ATMQ13315 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ATMQ13315 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
ATMQ13315 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ATMQ13315 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ATMQ13315 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
ATMQ13315 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ATMQ13315 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ATMQ13315 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
ATMQ13315 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
ATMQ13315 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
ATMQ13315 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.63□□□□□ -2.31
ATMQ13315 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
ATMQ13315 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ATMQ13315 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ATMQ13315 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
ATMQ13315 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ATMQ13315 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ATMQ13315 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC0.62□□□□□ -2.31
ATMQ13315 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC0.62□□□□□ -2.31
ATMQ13315 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
ATMQ13315 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
ATMQ13315 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
ATMQ13315 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
ATMQ13315 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
ATMQ13315 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ATMQ13315 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
ATMQ13315 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ATMQ13315 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ATMQ13315 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ATMQ13315 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ATMQ13315 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ATMQ13315 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ATMQ13315 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ATMQ13315 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ATMQ13315 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.61□□□□□ -2.31
ATMQ13315 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ATMQ13315 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ATMQ13315 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC0.61□□□□□ -2.31
ATMQ13315 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ATMQ13315 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ATMQ13315 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ATMQ13315 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ATMQ13315 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ATMQ13315 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ATMQ13315 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
ATMQ13315 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ATMQ13315 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
ATMQ13315 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC0.61□□□□□ -2.31
ATMQ13315 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ATMQ13315 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ATMQ13315 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ATMQ13315 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
ATMQ13315 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ATMQ13315 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
ATMQ13315 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
ATMQ13315 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ATMQ13315 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ATMQ13315 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
ATMQ13315 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ATMQ13315 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
ATMQ13315 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
ATMQ13315 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ATMQ13315 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ATMQ13315 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ATMQ13315 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
ATMQ13315 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ATMQ13315 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ATMQ13315 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
ATMQ13315 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
ATMQ13315 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ATMQ13315 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.31
ATMQ13315 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
ATMQ13315 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ATMQ13315 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ATMQ13315 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
ATMQ13315 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC0.59□□□□□ -2.31
ATMQ13315 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ATMQ13315 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC0.59□□□□□ -2.31
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