Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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ERCC8Q13216 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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ERCC8Q13216 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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ERCC8Q13216 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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