Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC1.73□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 AC012613.1-201ENST00000522685 387 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 AC006116.4-201ENST00000589671 452 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC1.71□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC1.71□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC1.71□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC1.71□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC1.71□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC1.71□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC1.71□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 AC023825.1-201ENST00000566704 1030 ntBASIC1.71□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC1.71□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
PRDM2Q13029 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
PRDM2Q13029 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PRDM2Q13029 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PRDM2Q13029 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
PRDM2Q13029 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PRDM2Q13029 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PRDM2Q13029 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PRDM2Q13029 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PRDM2Q13029 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PRDM2Q13029 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PRDM2Q13029 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PRDM2Q13029 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PRDM2Q13029 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PRDM2Q13029 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PRDM2Q13029 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PRDM2Q13029 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PRDM2Q13029 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PRDM2Q13029 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PRDM2Q13029 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PRDM2Q13029 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PRDM2Q13029 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PRDM2Q13029 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PRDM2Q13029 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PRDM2Q13029 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PRDM2Q13029 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PRDM2Q13029 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PRDM2Q13029 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.69□□□□□ -2.14
PRDM2Q13029 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
PRDM2Q13029 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
PRDM2Q13029 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PRDM2Q13029 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
PRDM2Q13029 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PRDM2Q13029 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PRDM2Q13029 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PRDM2Q13029 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PRDM2Q13029 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
PRDM2Q13029 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PRDM2Q13029 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PRDM2Q13029 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PRDM2Q13029 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC1.69□□□□□ -2.14
PRDM2Q13029 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
PRDM2Q13029 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
PRDM2Q13029 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PRDM2Q13029 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
PRDM2Q13029 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PRDM2Q13029 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PRDM2Q13029 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
PRDM2Q13029 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PRDM2Q13029 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
PRDM2Q13029 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PRDM2Q13029 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
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