Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXO1Q12778 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.7 ms