Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.2 ms