Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CENPFP49454 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
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CENPFP49454 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC0.7□□□□□ -2.3
CENPFP49454 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CENPFP49454 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC0.7□□□□□ -2.3
CENPFP49454 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CENPFP49454 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
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CENPFP49454 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.7□□□□□ -2.3
CENPFP49454 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CENPFP49454 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
CENPFP49454 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CENPFP49454 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CENPFP49454 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
CENPFP49454 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CENPFP49454 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CENPFP49454 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CENPFP49454 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CENPFP49454 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
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CENPFP49454 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CENPFP49454 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CENPFP49454 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
CENPFP49454 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC0.69□□□□□ -2.3
CENPFP49454 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CENPFP49454 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CENPFP49454 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CENPFP49454 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CENPFP49454 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
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CENPFP49454 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC0.68□□□□□ -2.3
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CENPFP49454 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
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CENPFP49454 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CENPFP49454 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
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CENPFP49454 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
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CENPFP49454 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
CENPFP49454 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CENPFP49454 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CENPFP49454 C5orf46-203ENST00000515291 573 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
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CENPFP49454 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
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CENPFP49454 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CENPFP49454 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
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CENPFP49454 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
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CENPFP49454 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC0.64□□□□□ -2.31
CENPFP49454 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
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CENPFP49454 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CENPFP49454 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CENPFP49454 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
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