Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 SNORD116-30-201ENST00000516468 85 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRMP28827 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 DEFB135-201ENST00000382208 234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
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PTPRMP28827 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
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PTPRMP28827 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
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PTPRMP28827 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPRMP28827 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
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