Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

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Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AireQ9Z0E3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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