Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk1eQ9JMK2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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