Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nectin1Q9JKF6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nectin1Q9JKF6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nectin1Q9JKF6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nectin1Q9JKF6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nectin1Q9JKF6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nectin1Q9JKF6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nectin1Q9JKF6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nectin1Q9JKF6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nectin1Q9JKF6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nectin1Q9JKF6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nectin1Q9JKF6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nectin1Q9JKF6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nectin1Q9JKF6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nectin1Q9JKF6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nectin1Q9JKF6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nectin1Q9JKF6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nectin1Q9JKF6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nectin1Q9JKF6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nectin1Q9JKF6 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nectin1Q9JKF6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nectin1Q9JKF6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nectin1Q9JKF6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nectin1Q9JKF6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nectin1Q9JKF6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nectin1Q9JKF6 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nectin1Q9JKF6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nectin1Q9JKF6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nectin1Q9JKF6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nectin1Q9JKF6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms