Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM5

Rhox9, Homeobox protein GPBOX, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox9Q9EQM5 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms