Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX13

Cnih4, Protein cornichon homolog 4, mousemouse

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Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih4Q9CX13 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Cnih4Q9CX13 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Cnih4Q9CX13 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnih4Q9CX13 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnih4Q9CX13 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Cnih4Q9CX13 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnih4Q9CX13 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnih4Q9CX13 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnih4Q9CX13 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnih4Q9CX13 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnih4Q9CX13 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnih4Q9CX13 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnih4Q9CX13 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnih4Q9CX13 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnih4Q9CX13 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnih4Q9CX13 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnih4Q9CX13 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnih4Q9CX13 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnih4Q9CX13 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnih4Q9CX13 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnih4Q9CX13 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnih4Q9CX13 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnih4Q9CX13 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnih4Q9CX13 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnih4Q9CX13 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnih4Q9CX13 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnih4Q9CX13 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnih4Q9CX13 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnih4Q9CX13 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnih4Q9CX13 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnih4Q9CX13 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnih4Q9CX13 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnih4Q9CX13 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnih4Q9CX13 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnih4Q9CX13 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnih4Q9CX13 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnih4Q9CX13 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnih4Q9CX13 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Cnih4Q9CX13 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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