Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Atp6v0e1Q9CQD8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Atp6v0e1Q9CQD8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Atp6v0e1Q9CQD8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Atp6v0e1Q9CQD8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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