Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms