Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU0

Chmp1b1, Charged multivesicular body protein 1b-1, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b1Q99LU0 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms