Protein–RNA interactions for Protein: Q96J66

ABCC11, ATP-binding cassette sub-family C member 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC11Q96J66 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ABCC11Q96J66 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms