Protein–RNA interactions for Protein: Q86WU2

LDHD, Probable D-lactate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHDQ86WU2 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDHDQ86WU2 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LDHDQ86WU2 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LDHDQ86WU2 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDHDQ86WU2 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDHDQ86WU2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDHDQ86WU2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDHDQ86WU2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDHDQ86WU2 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDHDQ86WU2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDHDQ86WU2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDHDQ86WU2 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDHDQ86WU2 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDHDQ86WU2 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDHDQ86WU2 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDHDQ86WU2 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDHDQ86WU2 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDHDQ86WU2 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDHDQ86WU2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDHDQ86WU2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDHDQ86WU2 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDHDQ86WU2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms