Protein–RNA interactions for Protein: Q86V59

PNMA8A, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8AQ86V59 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA8AQ86V59 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA8AQ86V59 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA8AQ86V59 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA8AQ86V59 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA8AQ86V59 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA8AQ86V59 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA8AQ86V59 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA8AQ86V59 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA8AQ86V59 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA8AQ86V59 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA8AQ86V59 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA8AQ86V59 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA8AQ86V59 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA8AQ86V59 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA8AQ86V59 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA8AQ86V59 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA8AQ86V59 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA8AQ86V59 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms