Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMD7

Dsg4, Desmoglein-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg4Q7TMD7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms