Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pan3Q640Q5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pan3Q640Q5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pan3Q640Q5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pan3Q640Q5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pan3Q640Q5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pan3Q640Q5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Pan3Q640Q5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Pan3Q640Q5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Pan3Q640Q5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Pan3Q640Q5 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pan3Q640Q5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pan3Q640Q5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pan3Q640Q5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pan3Q640Q5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Pan3Q640Q5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pan3Q640Q5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pan3Q640Q5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pan3Q640Q5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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