Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms