Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWC9

Gm3558, Predicted gene 3558, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3558Q5FWC9 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Gm3558Q5FWC9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
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Gm3558Q5FWC9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Gm3558Q5FWC9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3558Q5FWC9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Gm3558Q5FWC9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
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Gm3558Q5FWC9 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Gm3558Q5FWC9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Gm3558Q5FWC9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3558Q5FWC9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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