Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTK1

Chsy3, Chondroitin sulfate synthase 3, mousemouse

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Length 884 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy3Q5DTK1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Chsy3Q5DTK1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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