Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW98

Clca4b, Chloride channel accessory 4B, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca4bQ3UW98 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca4bQ3UW98 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms