Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx2P81066 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Irx2P81066 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx2P81066 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx2P81066 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx2P81066 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx2P81066 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms