Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Acta1P68134 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Acta1P68134 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Acta1P68134 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Acta1P68134 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Acta1P68134 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Acta1P68134 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Acta1P68134 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Acta1P68134 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Acta1P68134 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Acta1P68134 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms