Protein–RNA interactions for Protein: P61021

Rab5b, Ras-related protein Rab-5B, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5bP61021 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rab5bP61021 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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