Protein–RNA interactions for Protein: P56473

Agrp, Agouti-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AgrpP56473 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AgrpP56473 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AgrpP56473 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AgrpP56473 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AgrpP56473 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AgrpP56473 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AgrpP56473 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
AgrpP56473 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AgrpP56473 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AgrpP56473 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AgrpP56473 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AgrpP56473 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AgrpP56473 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
AgrpP56473 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AgrpP56473 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AgrpP56473 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms