Protein–RNA interactions for Protein: P48432

Sox2, Transcription factor SOX-2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox2P48432 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sox2P48432 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sox2P48432 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sox2P48432 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sox2P48432 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sox2P48432 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sox2P48432 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox2P48432 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox2P48432 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sox2P48432 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms