Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax7P47239 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax7P47239 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax7P47239 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms