Protein–RNA interactions for Protein: P46660

Ina, Alpha-internexin, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InaP46660 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
InaP46660 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
InaP46660 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
InaP46660 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
InaP46660 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
InaP46660 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
InaP46660 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
InaP46660 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
InaP46660 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
InaP46660 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
InaP46660 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
InaP46660 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
InaP46660 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
InaP46660 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
InaP46660 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
InaP46660 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
InaP46660 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
InaP46660 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
InaP46660 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
InaP46660 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
InaP46660 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
InaP46660 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
InaP46660 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
InaP46660 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
InaP46660 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
InaP46660 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
InaP46660 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
InaP46660 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
InaP46660 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
InaP46660 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
InaP46660 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
InaP46660 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
InaP46660 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
InaP46660 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
InaP46660 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
InaP46660 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
InaP46660 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
InaP46660 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
InaP46660 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
InaP46660 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
InaP46660 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
InaP46660 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
InaP46660 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
InaP46660 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
InaP46660 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
InaP46660 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
InaP46660 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
InaP46660 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
InaP46660 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
InaP46660 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
InaP46660 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
InaP46660 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
InaP46660 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
InaP46660 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
InaP46660 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
InaP46660 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
InaP46660 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
InaP46660 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
InaP46660 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
InaP46660 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
InaP46660 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
InaP46660 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
InaP46660 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
InaP46660 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
InaP46660 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
InaP46660 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
InaP46660 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
InaP46660 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
InaP46660 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
InaP46660 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
InaP46660 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
InaP46660 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
InaP46660 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
InaP46660 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
InaP46660 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
InaP46660 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
InaP46660 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
InaP46660 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
InaP46660 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
InaP46660 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
InaP46660 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
InaP46660 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
InaP46660 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
InaP46660 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
InaP46660 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
InaP46660 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
InaP46660 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
InaP46660 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
InaP46660 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
InaP46660 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
InaP46660 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
InaP46660 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
InaP46660 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
InaP46660 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
InaP46660 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
InaP46660 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
InaP46660 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
InaP46660 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
InaP46660 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
InaP46660 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms