Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd8P23463 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hoxd8P23463 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hoxd8P23463 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd8P23463 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd8P23463 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd8P23463 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd8P23463 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd8P23463 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd8P23463 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd8P23463 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd8P23463 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd8P23463 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd8P23463 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd8P23463 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd8P23463 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd8P23463 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd8P23463 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd8P23463 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd8P23463 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd8P23463 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd8P23463 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd8P23463 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd8P23463 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd8P23463 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd8P23463 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd8P23463 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd8P23463 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd8P23463 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd8P23463 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd8P23463 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd8P23463 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd8P23463 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd8P23463 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd8P23463 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd8P23463 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd8P23463 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd8P23463 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd8P23463 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd8P23463 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd8P23463 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd8P23463 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd8P23463 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd8P23463 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd8P23463 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd8P23463 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd8P23463 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd8P23463 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd8P23463 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd8P23463 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd8P23463 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd8P23463 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd8P23463 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd8P23463 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd8P23463 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd8P23463 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd8P23463 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd8P23463 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd8P23463 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd8P23463 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd8P23463 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd8P23463 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd8P23463 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd8P23463 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd8P23463 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd8P23463 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd8P23463 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd8P23463 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd8P23463 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd8P23463 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd8P23463 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd8P23463 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd8P23463 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd8P23463 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd8P23463 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd8P23463 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd8P23463 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd8P23463 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd8P23463 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd8P23463 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd8P23463 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd8P23463 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd8P23463 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd8P23463 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms