Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtrP07309 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtrP07309 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtrP07309 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtrP07309 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtrP07309 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtrP07309 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtrP07309 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtrP07309 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtrP07309 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtrP07309 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtrP07309 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtrP07309 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
TtrP07309 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
TtrP07309 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
TtrP07309 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
TtrP07309 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
TtrP07309 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
TtrP07309 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TtrP07309 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TtrP07309 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TtrP07309 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TtrP07309 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TtrP07309 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TtrP07309 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TtrP07309 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TtrP07309 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TtrP07309 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TtrP07309 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TtrP07309 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TtrP07309 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TtrP07309 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TtrP07309 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TtrP07309 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TtrP07309 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TtrP07309 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TtrP07309 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TtrP07309 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TtrP07309 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TtrP07309 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
TtrP07309 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TtrP07309 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TtrP07309 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TtrP07309 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TtrP07309 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TtrP07309 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
TtrP07309 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TtrP07309 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TtrP07309 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TtrP07309 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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TtrP07309 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TtrP07309 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TtrP07309 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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TtrP07309 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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TtrP07309 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TtrP07309 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TtrP07309 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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TtrP07309 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TtrP07309 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TtrP07309 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TtrP07309 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TtrP07309 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TtrP07309 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TtrP07309 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TtrP07309 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TtrP07309 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TtrP07309 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TtrP07309 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtrP07309 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtrP07309 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtrP07309 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtrP07309 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtrP07309 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtrP07309 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtrP07309 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtrP07309 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtrP07309 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtrP07309 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtrP07309 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtrP07309 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtrP07309 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtrP07309 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtrP07309 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtrP07309 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtrP07309 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtrP07309 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtrP07309 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtrP07309 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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