Protein–RNA interactions for Protein: O88909

Slc22a8, Solute carrier family 22 member 8, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a8O88909 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc22a8O88909 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms