Protein–RNA interactions for Protein: O88705

Hcn3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn3O88705 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcn3O88705 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms