Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ctnnal1O88327 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnnal1O88327 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms