Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ptpn20O55082 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ptpn20O55082 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ptpn20O55082 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ptpn20O55082 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ptpn20O55082 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ptpn20O55082 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ptpn20O55082 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ptpn20O55082 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ptpn20O55082 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ptpn20O55082 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ptpn20O55082 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms