Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2-Q1O19441 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-Q1O19441 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-Q1O19441 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-Q1O19441 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-Q1O19441 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-Q1O19441 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-Q1O19441 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-Q1O19441 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-Q1O19441 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-Q1O19441 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-Q1O19441 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-Q1O19441 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-Q1O19441 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-Q1O19441 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-Q1O19441 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-Q1O19441 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-Q1O19441 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms