Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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RABGEF1Q9UJ41 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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RABGEF1Q9UJ41 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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RABGEF1Q9UJ41 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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RABGEF1Q9UJ41 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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RABGEF1Q9UJ41 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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RABGEF1Q9UJ41 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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RABGEF1Q9UJ41 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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RABGEF1Q9UJ41 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
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RABGEF1Q9UJ41 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RABGEF1Q9UJ41 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
RABGEF1Q9UJ41 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
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