Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
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USP35Q9P2H5 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
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USP35Q9P2H5 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
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USP35Q9P2H5 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
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USP35Q9P2H5 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
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USP35Q9P2H5 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
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USP35Q9P2H5 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
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USP35Q9P2H5 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
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USP35Q9P2H5 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
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USP35Q9P2H5 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
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USP35Q9P2H5 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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