Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PHACTR1Q9C0D0 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
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