Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CLDN19Q8N6F1 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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