Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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