Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
MSMPQ1L6U9 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.6 ms