Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
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ECM1Q16610 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
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ECM1Q16610 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
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ECM1Q16610 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ECM1Q16610 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
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ECM1Q16610 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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ECM1Q16610 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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