Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
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SSX1Q16384 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
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SSX1Q16384 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
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SSX1Q16384 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
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SSX1Q16384 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
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SSX1Q16384 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
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SSX1Q16384 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
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SSX1Q16384 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
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