Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
USF2Q15853 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
USF2Q15853 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
USF2Q15853 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
USF2Q15853 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
USF2Q15853 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
USF2Q15853 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
USF2Q15853 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
USF2Q15853 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
USF2Q15853 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
USF2Q15853 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
USF2Q15853 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
USF2Q15853 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
USF2Q15853 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC1.95□□□□□ -2.1
USF2Q15853 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
USF2Q15853 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
USF2Q15853 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
USF2Q15853 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
USF2Q15853 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
USF2Q15853 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
USF2Q15853 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
USF2Q15853 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
USF2Q15853 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
USF2Q15853 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
USF2Q15853 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
USF2Q15853 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
USF2Q15853 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
USF2Q15853 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
USF2Q15853 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
USF2Q15853 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
USF2Q15853 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
USF2Q15853 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
USF2Q15853 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
USF2Q15853 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
USF2Q15853 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
USF2Q15853 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
USF2Q15853 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
USF2Q15853 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
USF2Q15853 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
USF2Q15853 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
USF2Q15853 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
USF2Q15853 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
USF2Q15853 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
USF2Q15853 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
USF2Q15853 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
USF2Q15853 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
USF2Q15853 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
USF2Q15853 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
USF2Q15853 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
USF2Q15853 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
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USF2Q15853 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
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USF2Q15853 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
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USF2Q15853 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
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USF2Q15853 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
USF2Q15853 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC1.93□□□□□ -2.1
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USF2Q15853 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
USF2Q15853 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
USF2Q15853 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
USF2Q15853 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
USF2Q15853 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
USF2Q15853 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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USF2Q15853 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
USF2Q15853 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
USF2Q15853 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
USF2Q15853 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
USF2Q15853 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
USF2Q15853 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
USF2Q15853 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
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