Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 AP000926.3-201ENST00000497201 299 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 RNU4-23P-201ENST00000362839 140 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 KATNBL1P4-201ENST00000503545 918 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC0.94□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 AC004994.1-201ENST00000447057 313 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC0.94□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 AC008676.3-201ENST00000521237 435 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC0.94□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 AL049812.3-201ENST00000412348 417 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 UBE2V2P4-201ENST00000447495 259 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC0.92□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
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