Protein–RNA interactions for Protein: Q15465

SHH, Sonic hedgehog protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHHQ15465 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SHHQ15465 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SHHQ15465 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SHHQ15465 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SHHQ15465 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SHHQ15465 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SHHQ15465 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SHHQ15465 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SHHQ15465 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SHHQ15465 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SHHQ15465 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SHHQ15465 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SHHQ15465 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SHHQ15465 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SHHQ15465 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SHHQ15465 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SHHQ15465 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SHHQ15465 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
SHHQ15465 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SHHQ15465 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SHHQ15465 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SHHQ15465 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SHHQ15465 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
SHHQ15465 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SHHQ15465 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SHHQ15465 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SHHQ15465 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SHHQ15465 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SHHQ15465 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SHHQ15465 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SHHQ15465 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SHHQ15465 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SHHQ15465 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SHHQ15465 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SHHQ15465 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SHHQ15465 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SHHQ15465 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
SHHQ15465 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SHHQ15465 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SHHQ15465 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SHHQ15465 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SHHQ15465 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SHHQ15465 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SHHQ15465 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SHHQ15465 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SHHQ15465 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SHHQ15465 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
SHHQ15465 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SHHQ15465 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SHHQ15465 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SHHQ15465 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SHHQ15465 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SHHQ15465 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SHHQ15465 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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SHHQ15465 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SHHQ15465 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SHHQ15465 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SHHQ15465 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SHHQ15465 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SHHQ15465 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SHHQ15465 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SHHQ15465 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SHHQ15465 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SHHQ15465 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SHHQ15465 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SHHQ15465 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SHHQ15465 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SHHQ15465 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SHHQ15465 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SHHQ15465 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SHHQ15465 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SHHQ15465 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SHHQ15465 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SHHQ15465 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SHHQ15465 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SHHQ15465 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SHHQ15465 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SHHQ15465 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SHHQ15465 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SHHQ15465 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
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SHHQ15465 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SHHQ15465 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SHHQ15465 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SHHQ15465 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SHHQ15465 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SHHQ15465 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SHHQ15465 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SHHQ15465 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SHHQ15465 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SHHQ15465 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SHHQ15465 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SHHQ15465 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SHHQ15465 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SHHQ15465 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SHHQ15465 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SHHQ15465 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SHHQ15465 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SHHQ15465 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
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