Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SCARB2Q14108 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.2 ms